雲林縣稅務局表示，信託房屋於信託關係存續中由受託人持有，不適用房屋稅條例第5條第1項第1款規定之自住住家用稅率（1.2%）課徵房屋稅，但自益信託房屋符合自住使用規定者，仍可按自住住家用稅率（1.2%）課徵房屋稅。 
稅務局進一步說明，信託房屋原則上不適用自住住家用稅率（1.2%）課徵房屋稅，但委託人與受益人同屬一人（自益信託），且該房屋仍供委託人本人、配偶或其直系親屬實際居住使用，與該房屋信託目的不相違背者，該委託人視同房屋所有權人，如同時符合「住家用房屋供自住及公益出租人出租使用認定標準」第2條規定（1.房屋無出租使用2.供本人、配偶或直系親屬實際居住使用3.本人、配偶及未成年子女全國合計三戶以內），准按自住住家用稅率（1.2%）課徵房屋稅。